奥尔法兽事件过后，随着时间流逝，御台场地区也渐渐复兴著。 　　“回到日本之后，我就决定一定要去大大的澡堂泡澡！”因为美美这句话，加上为了欢迎新加入的伙伴芽心和缅因猫兽，大家前往附近的温泉主题公园。虽然度过了一段开心的时光，但是这儿并没有阿丈的身影。 　　面对高考临近的事实，他在高考和“被选召的孩子们”的使命之间产生了烦恼。“为什么又必须是我们去面对啊？” 　　这个时候，在御台场再度出现了感染的数码...

缅因猫兽的暴走，以及由此引发的重启。 　　留下苦恼的芽心，太一等人前往数码世界。 　　重逢的搭档数码宝贝们，失去了至今为止的全部记忆。 　　即使如此也为了再次筑起羁绊，而伸出手去的被选召的孩子们，与回应此的数码宝贝们。 　　但，唯有比丘兽即使进化为成长期，也依然表现出警戒…… 　　“所以说过去的事情我不知道啦！” 　　面对比起自己更加优先关心他人的空的好意，比丘兽反而抱持着不信任感。 　　对于因受...

看到搭档望月芽心被有着玄内样貌的神秘男人所伤， 　　缅因猫兽再度开始暴走。 　　“不能让你诞生在世上…” 　　从现实世界消失的缅因猫兽，正是歪曲本身。是拥有过于巨大力量的，毁灭世界的钥匙—— 　　西岛大吾以及出现在望月博士之处的黑客兽，逐渐解明真相。 　　保证世界调和的恒常性将现在变得过于强大的缅因猫兽视为危险，而要将其切除。 　　随着暴走的缅因猫兽的出现，现实世界开始进入毁灭前的倒计时。 　　其...

世界的崩溃开始了。 　　暴走的大缅因猫兽吸收了黑暗进化的迪路兽、 　　用强大的力量进化成了秩序兽。 　　根据世界树的想法，现实世界将被数码世界所吞噬。 　　在绝望迫近的时候，被选中的孩子们拼命地向前。 　　现在太一不在了，能代替他带队的只有大 和。 　　「为了拯救世界，我们还有必须要做的事情！」 　　加布兽的话给大和带来了活力，而亚古兽则坚信太一定会回来。 　　另一方面，恒常性要处置失去控制的秩序...

新的一年，小新一家决定离开生活了多年的地方，举家前往墨西哥。在新的国度，小新一家遇到了很多新奇的人和事，同时也遭遇到了仙人掌怪物的袭击，小新不得不肩负起了保卫家人的重担。...

第四季终于进入美国篇，为了成为美国职业棒球手的吾郎只身前往美国。他刚一下飞机就遇到了小麻烦，一位名叫八木沼隼人的大学生帮助了他。八木和吾郎一样立志成为职业棒球手，于是两人便一同参加专业团体sammons的入团考试…… 　　吾郎的前进途中可谓困难重重，站上3A投手板的他，不得不与某个命中注定相遇的打手对峙。打手名为乔·吉普森·朱尼尔，正是那个“吉普森·朱尼尔”的儿子，不知为何，他莫名的憎恨着吾郎。这...