时间来到最终决战的两年后，在本应已迎来和平的地球上，怪兽们再度倾巢而出。 　　与此同时，世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT（精英胜利队）也迎来了新的队长——时冈（中村优一 饰），众人开启了调查。 　　一场关乎宇宙前途命运的鏖战就此拉开序幕。 　　挺身而出的G UTS-SELECT、前来驰援的泽塔奥特曼还有身处战斗中心的特利迦奥特曼的面前出现的是……浑身散发着不祥之...

空中响起奇怪的声音，人们一个接一个地倒下，并最终消失。出现在前往调查的精英部队GUTS-SELECT队员们面前的是，一波波来袭的外星人军团，以及驾驶着漆黑要赛艇“佐尔加乌斯”的支配者基贝尔斯教授，它妄图扭曲地球的天空。 　　奏大等人陷入苦战，这时，一个神秘的女性从天而降，她似乎知道基贝尔斯的事情。拥有着不可思议力量的女人名叫蒂娜丝。她与GUTS-SELECT队员们合作，以守护的使命迎战邪恶的阴谋。...

3000万年前，黑暗使世界陷入恐惧。 　　最终光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。 　　光之巨人也用尽了全力，在红色的星球上陷入长眠。 　　时光流转，在地球和平同盟TPU紧急组建精英小组“GUTS-SELECT”时，主人公真中剑悟正在刚刚开拓的火星上作为植物学家安稳地生活着。 　　但是有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了安稳宁静的生活。 　　当火星的街道被怪物破坏时，剑悟被命运引导，和沉睡...